Si, se pueden mezclar clips de distintas velocidades. Lo que hay que hacer es ajustar correctamente los parámetros del proyecto y de renderización para que te quede bien y no haya efecto fantasma.
El mayor problema que te vas a encontrar mezclando clips en R3 y R4 es que el primero es panorámica y el segundo no. Ojo que ambos son "gran angular" pero en R4 vas a tener más visión arriba y abajo (relación 4:3 en vez de 16:9). Por tanto si insertas sin más ambos vídeos al proyecto, el resultante te quedará con bandas negras. Tienes que recortar en este caso el R4 por arriba y por abajo para que te encaje en un proyecto panorámico y que no te queden bandas negras en los laterales.
Si no andas ducho en la edición, quizá sea mejor que lo grabes todo en R3 que de esa forma la edición será mucho más sencilla.